流水养鱼鱼种常见的鱼病有水鱼病，车轮虫，小瓜虫及细菌性鱼病，他们的防治如下：
1．水霉病： 用药为：食盐，浓度为5/1万，放养当天用药，每天一次，连续2天。
2．车轮虫，瓜虫病: 用药：硝酸亚汞，浓度为：0.2克/1立方米。用药时间为放养后第三天，每天一次，连续2天。
3．细菌性鱼病： 漂白粉和硫酸酮，浓度为：2克和0.7克/每立方米，时间为后第七天，每天一次，连续2天。
用药要主意的几点：
1．应选择晴天下午1时左右施药。
2．施药前3小时内要停止投饲。
3．药剂要充分溶夜化，切忌把药渣泼入池内，防止鱼类误食中毒。
4．撒药均匀，药液泼入鱼池后，用勺子拨动池水，使溶化均匀。
5．用药时停止水流或降低水流，约1小时后再恢复正常流量，但应注意鱼的动向，如出现严重浮头应立即恢复正常流量。
6．用药后2-3天可进行镜检，观察鱼的病体是否已消灭，然后决定是否还需用药或改换其它更合适的药物。
在循环过滤中如发现病鱼，对于药物的使用要特别慎重，因水是循环的，有些药物如硫酸铜等对过滤床中微生物都有较大的毒害作用。如发现病原体扩散时，必须对整个循环系统进行消毒，一般用40%的甲醛液，使整个系统浓度达到30毫克/升，这时生物膜暂时受到影响，不久仍能恢复。如停止水流用药浸洗鱼种，则浸洗后可将药液用水泵抽去，同时用增氧机在池内增氧或用压缩空气在池底送气增氧。有些寄生性病原体如小瓜虫，水霉病等一旦发生，只要提高流水系统水温达25度以上时，2—3天即可抑制鱼病。在发病季节也可在饲料内添加抗生素或其它有关药物制成药饲投喂，对防病有良效，若使用抗生素则以四环素